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磺丁基倍他环糊精钠在较宽的 pH 范围内（通常 pH 3–10）于水中保持稳定，不易发生降解。
在中性至弱碱性条件（pH 6–10）下，其化学结构最为稳定，糖苷键和磺丁基醚基团均不易断裂，溶液可长期储存而不发生明显降解。
在弱酸性条件（pH 3–6）下，稳定性略有下降，但降解速率缓慢，对其整体结构和功能影响较小。
在强酸性条件（pH＜2）下，由于糖苷键易受酸催化水解，可能缓慢分解为葡萄糖衍生物和含磺酸基的片段，导致溶液中磺丁基倍他环糊精钠的有效浓度降低。