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在常温（25℃左右）及低温（如 4℃冷藏）条件下，磺丁基倍他环糊精钠水溶液稳定性优异，可储存数周甚至数月而不发生明显降解，包合性能也基本保持不变。
在较高温度（如 60–80℃）下，短期加热（如制剂加工中的灭菌步骤）通常不会显著影响其稳定性；但长期处于高温环境（如＞100℃）时，可能加速糖苷键的水解，尤其在酸性条件下，高温会进一步加剧降解。
磺丁基倍他环糊精钠在水中与多数药物、辅料（如电解质、糖类、氨基酸等）具有良好的相容性，不易发生化学反应。
与金属离子（如 Na?、K?、Ca2?等）接触时，虽可能通过磺酸基发生弱离子相互作用，但这种作用通常不影响其结构稳定性，也不会导致沉淀或分解。
与强氧化剂或还原剂共存时，由于其分子中不含易氧化或还原的基团（如醛基、不饱和键），整体仍能保持稳定，不易发生氧化还原反应。